SMA Santo Lukas Pemalang berdiri sejak 1982 yang dikelola oleh Yayasan Santo Lukas Pemalang (Suster PBHK). Tahun 1987 secara resmi diakui oleh Dirjen Dikdasmen Sekolah Swasta Depdikbud dengan NDS C11014006 berlamat di Jl. Pemuda 20 Pemalang tepatnya Perguruan Pius Pemalang. Saat masih bersama Perguruan Pius pembelajaran dilakukan di sore hari. Tahun 1997, SMA Santo Lukas menempati gedung baru di lokasi tanah Gereja Santo Lukas Pemalang dengan alamat Jl. Pemuda 28 Pemalang. Tahun 2003, atas inisiatif dari Yayasan Santo Lukas, melalui  Bapak Uskup Purwokwerto, Mgr. Julius  Sunarka, SJ menawarkan karya pendidikan ini ke Yayasan Pangudi Luhur, lewat Kongregasi Bruder FIC, di Semarang. Tahun 2004-2005, Kongregasi FIC dan  Yayasan Pangudi Luhur  mengadakan penjajakan karya, dengan mengutus Br. Bonifasius Kasmo, FIC berkarya di SMA Santo Lukas. Pada  Tahun  2006, Yayasan Pangudi Luhur  mengambil  alih secara resmi  menjadi karya Yayasan Pangudi Luhur, dengan nama SMA Pangudi Luhur Santo Lukas  

“ Terwujudnya sekolah unggul yang berwawasan lingkungan, demi terbentuknya pribadi Beriman, Cerdas, Terampil, Mandiri, dan Andal sebagai Calon pemimpin.”

1. Memberikan pelayanan pendidikan dan pengajaran Berkualitas, terencana, tertib, disiplin, dan konsisten sebagai Sekolah Unggul, dengan semangat “Kasih”
2. Mendampingi kaum muda agar berkembang dalam intelektualitas, emosional, humanitas, moralitas, spiritualitas dan keterampilan (Be Compassionate, Faithful, and Smart).
3. Menanamkan Karakterk Kepemimpinan dan kewirausahaan dengan pendidikan vokasi.
4. Memberikan perhatian khusus kepada siswa yang KLMTD-BK.
5. Mewujudkan kehidupan yang peduli dan bertanggung jawab terhadap lingkungan
6. Mewujudkan kehidupan yang mencerminkan kesetiaan dan kasih persaudaraan
   (Compassionate, Faithful).

Menyiapkan kaum muda menjadi pribadi, yang:

1. Cerdas intelektual, rendah hati, humanis, peduli lingkungan, (alam dan sesama), bermoral, dan beriman.
2. Berorientasi masa depan.
3. Siap melanjutkan pendidikan dan atau hidup bermasyarakat.
4. Menjunjung tinggi kasih persaudaraan dan kesetiaan

Mutu Pembelajaran, Mutu Sekolahku

Be Compessionate, Faithful and Smart

(Berbelas Kasih, Setia dan Cerdas)